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量子化学計算のデファクトスタンダード
『Gaussian』は、多種多様な分子・化学反応を解析・設計するための量子化学計算ソフトウェアです。最も有名で利用者の多い量子化学系さんソフトウェアで、分子設計・構造解析・化学反応解析などで多大な成果をもたらしています。 2017年はじめに、Gaussian 16（量子化学計算ソフトウェア）ならびGaussView 6がリリースされました。本リリースは約7年ぶりとなるメジャーバージョンアップです。
自動的にクオリティの高い図を作成！さまざまな画像フォーマットに対応します
『PoseView』は、リガンド-タンパク質間の相互作用の 2 次元図を作成するためのツールです。 相互作用しているアミノ酸の種類や原子、相互作用の種類（水素結合、 疎水性相互作用、π-π相互作用）を分かりやすく 2 次元で表示することができます。 操作はタンパク質構造とリガンド構造を入力するだけで、得られた図は 各種画像フォーマットで出力することが可能 。作成された図は、多くの 論文で活用され、Protein Data Bankの公式の相互作用図としても採用 されております。 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
操作はタンパク質構造とリガンド構造を入力するだけ！
『PoseView』は、リガンド-タンパク質間の相互作用の2次元図を 作成するためのツールです。 相互作用しているアミノ酸の種類や原子、相互作用の種類 （水素結合、疎水性相互作用、π-π相互作用）を分かりやすく 2次元で表示することができます。 得られた図は各種画像フォーマットで出力することが可能です。 【特長】 ■リガンド-タンパク質間の相互作用の2次元図を作成 ■相互作用しているアミノ酸の種類や原子などを分かりやすく2次元で表示 ■操作はタンパク質構造とリガンド構造を入力するだけ ■作成された図は、Protein Data Bankの公式の相互作用図として採用されている ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
材料科学、生命科学向け力場パラメータデータベースと量子化学計算をもとにした力場パラメータ開発機能により力場計算の問題を解決
「力場パラメータが足りなくて計算できない」、「化学的に誤った構造を結果として与える」、これらは、分子シミュレーションソフトウェアに付属する力場パラメータを利用して計算を行うと、しばしば直面する問題です。 Direct Force Fieldは、開発元の提供する高精度な力場パラメータを登録した力場パラメータデータベースと量子化学計算をもとにした力場パラメータ開発機能により、力場パラメータの問題を解決します。 ※機能などの詳細はカタログをご覧ください。
新たに2つの目的に対する力場が追加！5つの系統の陽イオンと12種類の陰イオンに対応！
「Direct Force Field」は、力場作成とAeon社の開発した力場を利用するための ソフトウェアです。 力場を作成するために必要な機能を簡単な手順で利用できるようになっており、 開発された力場を管理するデータベースが搭載されています。 当資料では、2020年12月にリリースされた新バージョン『Direct Force Field 7.2』 についてご紹介しています。 是非、ご一読ください。 【掲載内容】 ■Direct Force Field 概要 ■新機能の紹介 ■参照文献 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
性質の異なる物質を同時に取り扱える！到達困難な大規模・長時間シミュレーション
『MedeA』は、第一原理計算や力場計算を基に材料のさまざまな物性を 算出することができる分子シミュレーションの統合環境です。 機械学習力場パラメーターを作成・使用できるツール、MLP/MLPGが 搭載されているので、第一原理計算に近い精度で大規模・長時間の シミュレーションが可能です。 当資料では、機械学習ポテンシャルの作成・使用環境を実装した MedeA MLP/MLPG について、その概要を紹介しておりますので、 是非ご覧ください。 【掲載内容】 ■機械学習ポテンシャル ■MLPGによるパラメーターフィッティング ■MedeA MLP/MLPG ■適用事例 ■まとめ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
MOEノードまたは既存のノードを組み合わせてワークフローを作ることで解析処理を可視化・保管できます
KNIMEは、オープンソースのデータ分析やレポート作成を行うための統合プラットフォームです。MOE Extensions for KNIME は、MOEを計算エンジンに用いたKNIMEノードの総称で、Ver. 2.4.0では180を超える解析ノード(MOEノード)が提供されます。 ユーザーは、KNIME上で各種MOEノードを組み合わせて、化合物処理、QSAR解析、ファーマコフォア検索、ドッキングシミュレーション、ホモロジーモデリング、タンパク質デザインを行うためのワークフローを作成できます。 プログラミングを行わなくても、GUI上でノードアイコンをつなぐだけで、作業の自動化・効率化・標準化が実現します。 MOEノードと、既存のデータマイニングやマシンラーニング（機械学習）などのノード、サードパーティ製品のノードも自由に組み合わせることができ柔軟なワークフローの設計が可能になります。
簡単かつ柔軟なワークフロー作成！KNIMEで動作するMOEインターフェイス
『MOE-Extensions for KNIME』は、MOEをワークフローツール 「KNIME」上で使用するためのインターフェイスです。 当製品を利用することで、化合物や受容体構造の前処理、 ドッキング、FBDD、ファーマコフォア検索などのMOEによる 連続的な処理を容易に定義できます。 【特長】 ■誰でも分かりやすい形で計算プロトコルを定義 ■プログラミング不要で作業を自動化 ■処理の追加、削除、順番の入れ替えが容易 ■創薬研究のための多数のノードを提供 ■KNIMEの他ノードとの連携が容易（機械学習等） ■ユーザーオリジナルノードの作成が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
Direct Force Fieldの力場パラメーターアサインから分子動力学計算までの力場計算機能をご紹介
Aeon Technology 社は高精度分子シミュレーション支援ソフトウェア 「Direct Force Field」を通じ、力場データベースから力場開発ツールまで 力場計算に関するさまざまなツールを提供しています。 当資料では、Direct Force Field (DFF) の力場パラメーターアサインから 分子動力学計算までの力場計算機能についてご紹介いたします。 【掲載内容】 ■はじめに ■分子構造の作成 ■形式電荷のアサイン ■モデル分子へのパラメーターアサイン ■分子動力学計算用入力ファイルの生成 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
研究情報管理統合プラットフォーム「Scilligence」と連携で効率的な研究が可能！
米国Scilligence 社製『TouchMol4Office』は、Microsoft Office への プラグインです。 Microsoft Officeの各ソフトウェア内で化学的・生物学的機能を用いて 構造情報を含む研究データを整理することができ、研究データの解析や レポート作成を容易に行えます。 また、Scilligence ELN（電子実験ノート）などと連携して利用すること により研究を効率的に行えます。 当資料では、当製品の概要と機能についてご紹介します。 【掲載内容】 ■概要 ■機能 ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
タンパク質デザイン機能やタンパク質解析の為の様々な機能が搭載
「MOE 2016.08」には新規アプリケーションとして「MOEsaic」が追加 されました。Matched MolecularPair（MMP）解析やR-group 解析などの SAR 解析、分子設計、文書作成が行えるウェブアプリケーションです。 「MOEsaic」を用いることで、重要な置換基の検出、キー化合物の発見、 新規化合物の設計、解析で得られた知見の記録が効率的かつ直感的に行えます。 【MOEsaic 機能】 ■リガンド解析とSAR解析のためのWebアプリケーション ■部分構造と類似構造検索 ■R-group解析とプロファイリング ■Matched Molecular Pair解析（MMPs） ■新規バーチャルリガンドデザイン ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
データ解析の専門家からデータ解析に不慣れなウェットの研究者まで幅広くご利用可能！
『Partek Flow』は、次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。 次世代シーケンサーから出力されたリード配列を読み込んで、RNA-Seqや DNA-Seq、ChIP-Seq、Single Cell RNA-Seq、メタゲノム等のデータを解析することが可能。 また、搭載されているすべての解析ツールをグラフィカルユーザー インターフェース上で選択できるので、コマンドでの操作を必要としません。 当資料では、k-meansクラスタリングによる細胞の分類やマーカー遺伝子の 表示、UMAPによる次元削減、遺伝子リストの作成など、Single Cell RNA-seqデータ解析に有用な機能について紹介します。 【掲載内容】 ■クラスタリング ■次元削減による可視化 ■発現変動遺伝子リスト ■ご試用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
